Освітній процес у закладі проводиться згідно Освітньої програми Чертезької спеціальної загальноосвітньої школи-інтернату І-ІІ ступенів затвердженої директором школи та схваленої рішенням педагогічної ради закладу, яка передбачає вивчення наступних навчальних предметів:
Українська мова і література
Математика
Історія України
Я і у Світі
Музичне мистецтво
Образотворче мистецтво
Природознавство
Географія
Інформатика
Фізика і хімія у побуті
Основи здоров'я
Фізична культура
Трудове навчання