Освітній процес у закладі проводиться згідно Освітньої програми Чертезької спеціальної загальноосвітньої школи-інтернату І-ІІ ступенів затвердженої директором школи та схваленої рішенням педагогічної ради закладу, яка передбачає вивчення наступних навчальних предметів:

Українська мова і література

Математика

Історія України

Я і у Світі

Музичне мистецтво

Образотворче мистецтво

Природознавство

Географія

Інформатика

Фізика і хімія у побуті

Основи здоров'я

Фізична культура

Трудове навчання